手持三维扫描仪扫描速度是选择扫描仪的重要参数，因为扫描时间决定整体产量的重要因素。就如精确度一样，扫描速度也没有什么标准可以使其易于与市场的营销材料和所宣称的内容相最。在没有公认的参照物情况下，凭经验对比后发现对于同一个基本的代型，所宣称的扫描时间可能在30秒到几分钟之间变化。较严格的制造商会就所选定的只要指征披露他们的扫描时间。

一般来说，单单研究扫描时间值并不会发现扫描仪在产量方面的能力。技工所需要考虑整个工作流程，从创建订单开始到制成一个完全可供CAD设计使用的三维扫描结束。这自然不只跟扫描仪硬件有关，还跟驱动系统有关。从这个角度对比不同的扫描仪品牌的产量会发现更大的性能变化。

高度自动化可以让用户缩短整个扫描过程的时间。自动化同时还可以降低人工出错的可能性，因为有利于避免返工——这是所有错误中最花时间的。例如，通过人工控制的摄像光亮度调节可能会导致图像过分曝光，这样投射的光线线条就不再可能被探测到。

某些硬件的功能可以节省处理时间。在没有操作者的情况下，扫描仪在一根代型传送杆或多代型板的作用下可以工作许多分钟。一个技师可以同时使用多台扫描仪工作，或者有效利用空余时间在CAD软件中设计修复体。优良的种植牙钉可以减少失败的次数，这是令人恼怒的浪费时间的根源。

对扫描速度最真实的信息来源很有可能会在用户评价(尤其是关于失败率的评价)中，以及显示整个扫描过程的视频中找到。